Als Leiter des Arbeitskreises hat Schirmer sich u.a. für den Aufbau und die Leitung eines interdisziplinären Projektes zur Erstellung von Leitlinien für die intensivmedizinische Versorgung herzchirurgischer Patienten eingesetzt, die in Zusammenarbeit mit der Deutschen Gesellschaft für Thorax-, Herz- und Gefäßchirurgie zur ersten Leitlinie der DGAI „Monitoring und Herz-Kreislauftherapie“ führte. Seit 2003 ist Schirmer Mitglied der wissenschaftlichen Programmkommission „Herz-Kreislauf“ des Deutschen Anästhesiekongresses, Mitglied im wissenschaftlichen Beirat des Hauptstadtkongresses für Anästhesiologie und Intensivtherapie (HAI) der DGAI, Vertreter Deutschlands in der Mitgliederversammlung der EACTA, Mitglied im Directory Board der EACTA als Membership Secretary sowie Mitglied im wissenschaftlichen Beirat der Deutschen Gesellschaft für Kardiotechnik. Prof. Schirmer ist zudem Herausgeber und Beiratsmitglied anerkannter Fachzeitschriften.
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